食品科学与工程一级学科硕士点设有4个研究方向：

1.水产品贮藏与加工:以南海大宗水产品资源为原料，重点开展贮藏加工特性、保活与低温流通技术、加工副产物综合利用、加工新技术等方面的基础理论和关键技术研究，为南海区乃至全国水产品加工业的健康发展提供重要的理论和技术支撑。

2.南海生物活性物质研究与开发:以南海海洋生物为主要研究对象，重点围绕海洋生物活性物质的分离纯化、结构解析、功效评价、规模化生产及开发应用等方面的科学与关键技术问题进行了研究，为海洋保健品、药物和天然高效抗菌剂等的开发提供科学依据与技术支撑。

3.水产食品质量与安全:围绕南海水产品产业链中质量与安全关键科学与技术问题，重点开展有害因子的识别、发生、残留规律、快速检测与风险分析和预警以及质量安全控制体系等方面的研究，为华南地区水产品安全生产提供技术支撑。

4.农产品深加工与保健食品开发:以岭南地方特色农产品资源为对象，重点开展果蔬采后生理与贮藏保鲜、亚热带果蔬精深加工和食品新资源研究与保健开发等方面研究，为亚热带果蔬贮藏保鲜与加工以及食品新资源开发与利用提供理论依据与技术支撑。